News
August 2016: Looking for a postdoc, PhD or job? We are hiring!
July 2016: Our paper on virulence adaptive polymorphisms is out in biorxiv.
June 2016: Nico's paper on predicting & characterising cyanobacterial bloom dynamics is out in biorxiv.
Jesse gives a microseminar on Tradeoffs in pathogen evolution
April 2016: Jesse asks: How clonal are bacteria over time?
March 2016: Jesse, J-B and Jim Mallet ask: What is Speciation?
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July 2016: Our paper on virulence adaptive polymorphisms is out in biorxiv.
June 2016: Nico's paper on predicting & characterising cyanobacterial bloom dynamics is out in biorxiv.
Jesse gives a microseminar on Tradeoffs in pathogen evolution
April 2016: Jesse asks: How clonal are bacteria over time?
March 2016: Jesse, J-B and Jim Mallet ask: What is Speciation?
Why Microbial Evolutionary Genomics?
Most of the genetic and metabolic diversity that exists on earth – and has existed for billions of years – is microbial. Arguably more impressive than the sheer quantity of microbial diversity is its dynamic nature: microbes are constantly evolving and adapting. Our ongoing research tracks evolving microbial populations in real time, using whole-genome and whole-community DNA sequencing to understand their evolution and predict how they adapt to changing environments. For example:
(1) freshwaters subject to seasonal cyanobacterial blooms,
(2) the human gut, focusing on cholera infections,
(3) viral hemorrhagic fevers (Lassa and Ebola),
(4) evolution of antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis.
Pourquoi la Génomique Microbienne Évolutive ?
La plupart de la diversité génétique et métabolique qui existe - et a existé depuis des milliards d'années - est de nature microbienne. Plus impressionnant que l'énorme quantité de diversité microbienne est sa nature dynamique: les microbes sont constamment en train d'évoluer et de s'adapter à leur environnement. Notre programme de recherche suit l'évolution des populations microbiennes en temps réel, en utilisant le séquençage de génomes (de souches individuelles) et de métagénomes (l'ADN de communautés entières) afin de comprendre leur évolution et prédire comment ils s'adaptent à des environnements changeants. Par exemple:
(1) les eaux douces qui subissent des proliférations saisonnières de cyanobactéries,
(2) l'intestin humain, en se concentrant sur les infections de choléra,
(3) les virus hemorragiques (Lassa et Ebola),
(4) l'évolution de l'antibiorésistance en Mycobacterium tuberculosis.
(1) freshwaters subject to seasonal cyanobacterial blooms,
(2) the human gut, focusing on cholera infections,
(3) viral hemorrhagic fevers (Lassa and Ebola),
(4) evolution of antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis.
Pourquoi la Génomique Microbienne Évolutive ?
La plupart de la diversité génétique et métabolique qui existe - et a existé depuis des milliards d'années - est de nature microbienne. Plus impressionnant que l'énorme quantité de diversité microbienne est sa nature dynamique: les microbes sont constamment en train d'évoluer et de s'adapter à leur environnement. Notre programme de recherche suit l'évolution des populations microbiennes en temps réel, en utilisant le séquençage de génomes (de souches individuelles) et de métagénomes (l'ADN de communautés entières) afin de comprendre leur évolution et prédire comment ils s'adaptent à des environnements changeants. Par exemple:
(1) les eaux douces qui subissent des proliférations saisonnières de cyanobactéries,
(2) l'intestin humain, en se concentrant sur les infections de choléra,
(3) les virus hemorragiques (Lassa et Ebola),
(4) l'évolution de l'antibiorésistance en Mycobacterium tuberculosis.
We are here // Nous sommes ici :
Pavillon Marie-Victorin
90 Vincent d'Indy
Montreal, QC
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